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Onkologische Forschungsgruppen des Mikrobiologischen Institutes

Mikrobiologisches Institut

Leitung

Prof. Dr. Kilian Schober

 

Überblick Forschungsinhalte

Die AG Schober untersucht humane antigenspezifische T-Zell-Antworten. Schwerpunkte liegen auf der Identifizierung von Epitopen und T-Zell-Rezeptoren, genetischem Engineering von T-Zellen sowie einer Charakterisierung der zellulären Dynamik von T-Zell-Antworten im Rahmen von Infektionen, Autoimmun- und Tumorerkrankungen.

 

Team

  • Lucia Klotz
  • Dr. Ev-Marie Schuster
  • Dr. Michael Hiltensperger
  • Dr. Nikolaj Kristensen
  • Dr. Myriam Grotz
  • Dr. Jesse Mulder
  • Julia Benz
  • Sina Frischholz
  • Elif Karay
  • Eva Brunner
  • Marianna Sousa

 

Laufende Forschungsprojekte

  • Horizon Europe, Yellow4FLAVI, Projekt 101137459: Deconstructing the protective immunity of yellow fever virus 17D to inform flavivirus vaccine design
  • DFG GRK2504, Projekt 401821119: Ex vivo metabolic profiling of human antigen-specific T cell responses after yellow fever and SARS-CoV-2 mRNA vaccination
  • BMFTR, Nachwuchsgruppen in der Infektionsforschung, Projekt 01KI2015: INTRA-SEQ (Infection Diagnostics T Cell Receptor Analysis and Sequencing)
  • Aventis Foundation, Projekt 2024: Life Science Bridge Award
  • DFG Heisenberg, Projekt SCHO 1949/1-1: Verstehen und Engineering humaner Antigen-spezifischer T-Zell-Immunität
  • Hector Foundation, Projekt T-Zellrezeptor: T-Zellrezeptor-Transfer zur Therapie der HIV-1-Infektion
  • DFG, TRR 221, Projekt A09: Identification of T cell receptors and their epitopes mediating GvL responses in acute myeloid leukemia
  • DFG, SFB 1755, Projekt 13: The role of T cell responses in the persistence of systemic inflammation and treatment failure in inflammatory bowel disease

 

Methoden

  • Durchflusszytometrie
  • Einzelzell-RNA-Sequenzierung
  • CRISPR/Cas9

 

Kooperationspartner

Erlangen

Matthias Tenbusch
Thomas Winkler
Klaus Überla
Andreas Mackensen
Simon Völkl
Mario Zaiss
Frederik Graw
Moritz Leppkes
Kai Hildner
Thomas Harrer
Christoph Alexiou
Horia Sirbu
Markus Eckstein
Christian Bogdan
Stephan Rosshart
Krystelle Nganou
Fabian Müller
 

Extern
Dirk Busch (Munich)
Benjamin Schubert (Munich)
Ulrike Protzer (Munich)
Anne Krug (Munich)
Simon Rothenfußer (Munich)
Gerhard Krönke (Berlin)
Johannes Huppa (Berlin)
Alexander Scheffold (Kiel)
Petra Bacher (Kiel)
Veit Buchholz (Heidelberg)
Dimitrios Mougiakakos (Magdeburg)
Luca Gattinoni (Regensburg)
Jochen Hühn (Braunschweig)
Ralf Schmidt (Vienna)
Judith Aberle (Vienna)
Paul Thomas (Memphis)
Marcus Buggert (Stockholm)
Hans-Gustaf Ljunggren (Stockholm)

 

Publikationen/Literatur

https://sites.google.com/view/schoberlab/publications

 

Kontakt

Prof. Dr. med. Kilian Schober

Arbeitsgruppenleiter

09131 85-32644

kilian.schober(at)uk-erlangen.de

 

Weiterführende Links

www.schoberlab.de

 

Stand: 04/2026

Leitung

Prof. Dr. Jochen Mattner
 

Überblick Forschungsinhalte

Das menschliche Immunsystem und die Mikrobiota, eine Ansammlung unterschiedlicher Bakterien, Pilze, Viren und Protozoen, die unsere äußeren und inneren Körperoberflächen wie z.B. Darm und Haut besiedeln, stehen in enger und wechselseitiger Interaktion miteinander. So generiert das Immunsystem über verschiedene, häufig noch unverstandene Mechanismen eine Immuntoleranz gegenüber diesen kommensalen Mikroorganismen, während die Mikrobiota für die Entwicklung und Funktion des (muko-)epithelialen und systemischen Immunsystems von entscheidender Bedeutung ist. Dabei spielen unterschiedliche Stoffwechselprodukte und die Neusynthese verschiedener Verbindungen, die als Signalmoleküle im Immunsystem fungieren, für die Physiologie und Homöostase lokaler und systemischer Gewebs- und Organsysteme eine essenzielle Rolle. Die Mikrobiota kann aber auch die Entwicklung und den Verlauf entzündlicher und maligner Erkrankungen beeinflussen bzw. die Transformation chronischer Entzündungen in Krebserkrankungen begünstigen. Diese Erkrankungen sind zudem häufig mit einem Ungleichgewicht der kommensalen Standort-Flora, einer sogenannten Dysbiose, assoziiert. Zudem können Mikrobiota das Ansprechen der Patienten/-innen auf verschiedene Krebstherapien wie z.B. Checkpoint-Inhibitoren sowie deren Nebenwirkungsprofil verändern. Wir versuchen in diesem Zusammenhang Muster in der Zusammensetzung und Funktion der kommensalen Mikrobiota an den entsprechenden anatomischen Lokalisationen sowie verschiedener Stoffwechselprodukte zu erkennen, die mit einer malignen Zelltransformation einhergehen könnten. Diese Strategien besitzen somit das Potential, eine verbesserte Erkennung, Prävention und Behandlung verschiedener Krebserkrankungen im Darm und auf der Haut zu ermöglichen.

 

Team

Harald Arnold
Wenyang Gao
Claudia Giessler
Lukas Hintze
Tim Holland
Luis Lopez-Marecos
Victoria Schirmer
Vanessa Wiesner

 

Laufende Forschungsprojekte

  • DFG MA 2621/5-1, IZKF A108
  • IZKF Discover S4
  • Staedtler Stiftung
  • Sino-German Center Mobility Programme M-0693 

 

Methoden/Studien

  • NGS, 16S rRNA Analysen
  • präklinische in vivo Modelle
  • funktionelle Analysen verschiedener Patientenproben

 

Kooperationspartner

  • Felix Broecker, Idorsia, Berlin
  • Heiko Bruns, Medizinische Klinik 5, UKER
  • Michael Erdmann, Hautklinik, UKER
  • Roman Gerlach, Klinische Mikrobiologie, UKER
  • Claudia Günther, Medizinische Klinik 1, UKER
  • Manfred Rauh, Kinderklinik, UKER
  • Peter Seeberger, Max-Planck-Institut für Kolloid- und Grenzflächenforschung, Potsdam
  • Stefan Wirtz, Medizinische Klinik 1, UKER

 

Publikationen

  1. Holland, T., Mattner, J. Metaplastic epithelial cells: origination from stem cells and promotion of intestinal inflammation. Sig Transduct Target Ther 10, 80 (2025). https://doi.org/10.1038/s41392-025-02165-3
  2. Nüse, B., Holland, T., Rauh, M., Gerlach, R. G., & Mattner, J. L-arginine metabolism as pivotal interface of mutual host-microbe interactions in the gut. Gut Microbes, 15(1) (2023). https://doi.org/10.1080/19490976.2023.2222961
  3. Nüse, B., Holland, T. & Mattner, J. Immune responses to tumor-unrelated antigens might predict adverse effects in patients treated with anti-PD-1 immunotherapy. Cell Mol Immunol 20, 313–315 (2023). https://doi.org/10.1038/s41423-022-00947-1
  4. Baier J, Gänsbauer M, Giessler C, Arnold H, Muske M, Schleicher U, Lukassen S, Ekici A, Rauh M, Daniel C, Hartmann A, Schmid B, Tripal P, Dettmer K, Oefner PJ, Atreya R, Wirtz S, Bogdan C, Mattner J. Arginase impedes the resolution of colitis by altering the microbiome and metabolome. J Clin Invest. 130(11): 5703-5720 (2020) doi: 10.1172/JCI126923.  https://doi.org/10.1172/JCI126923 
  5. Mattner J, Wirtz S. Friend or Foe? The Ambiguous Role of Innate Lymphoid Cells in Cancer Development. Trends Immunol. 38(1):29-38 (2017). https://doi.org/10.1016/j.it.2016.10.004
  6. Mattner J, Schmidt F, Siegmund B. Faecal microbiota transplantation-A clinical view. Int J Med Microbiol. 306(5):310-315 (2016). doi.org/10.1016/j.ijmm.2016.02.003

 

Kontakt

Prof. Dr. Jochen Mattner
Research group leader

09131 85 33644

jochen.mattner(at)uk-erlangen.de

 

Weiterführende Links

https://www.mikrobiologie.uk-erlangen.de/en/research/research-groups/research-group-of-prof-j-mattner/

 

Stand: 04/2026